马尾海战后第三天，孤拔指挥他们的舰队继续沿闽江而上，妄图占领福州。此时，福建水师已全军覆没，孤拔认为闽江上可以横冲直撞了。但是，他哪里知道，闽江两岸还有坚固的炮台。当他们沿江而上时，两岸炮火突然山崩地裂般的朝法舰打过去。当场死伤60多人。孤拔率领舰队拼死逃出，继续前进。又多次遭到伏击。不得已，他命令舰队调转船头撤出闽江，向海上逃窜。当孤拔乘坐的“伏尔他”号驶出闽江口隘水道时，坚守金牌山炮台的杨金宝早已率领军民等候多时，一声令下各炮齐轰，将孤拔打死在了望台上。
他饮弹毙命后，尸体由法舰运往我国台湾澎湖，葬于马公岛上，作了他乡鬼。