由于贵族在起义初期突然被吓得不知所措，只顾四散奔逃，所以农民起义能够那样迅速地获得巨大的成功。后来所有反动势力都联合起来。原想利用法王约翰被俘之机攫取法兰西王位的纳瓦拉国王“恶人”查理，与法国处于交战状态的英国封建主，都来帮助法国统治阶级镇压农民起义。太子查理的骑士军和纳瓦拉国王“恶人”查理的军队奉命出动。6月8日，吉约姆·卡勒农民起义军主力在麦洛村附近与“恶人”查理的骑士军精兵约1000人遭遇。吉约姆·卡勒正确地判断，在空旷的地方进行战斗，农民是无法得胜的，于是动员农民向巴黎进发。但是，农民没有听从他们领袖的劝告，声称他们决不后退一步。因此，吉约姆·卡勒将农民起义军部署在能控制周围地区的山地上，用马车筑起一道围障，将弓弩手配置在第一线，并将一支600人的骑兵队留作预备队。在起义军高昂的斗志及强大的阵容面前，骑士军几天内不敢向农民起义军发动进攻，转而施用诡计。“恶人”查理假意邀请吉约姆·卡勒进行谈判，订立停战协定。吉约姆·卡勒没有以人质保证自己的安全，轻信赴会，被背信弃义的“恶人”查理扣留。封建主的军队乘农民起义军中无主，发动猛攻。失去领袖的农民起义军抵挡不住铁甲骑士的突然打击而溃败。

　　统治者到处对农民进行血腥镇压，到6月24日为止，残杀农民达2万多人。两个月后，直到贵族们唯恐没有人给他们收割庄稼，对农民所进行的血腥镇压才算停止。吉约姆·卡勒遭受酷刑后壮烈牺牲。扎克雷起义终于失败了，此后，巴黎市民的起义也以失败而告终。

　　扎克雷起义失败的主要原因，一方面是由于缺乏坚强的组织和明确的斗争纲领，另一方面则是由于没有得到可靠的同盟者。城市上层市民在利用农民起义达到自己的目的之后，立即背叛和出卖农民。城市贫民虽然支持起义，但力量薄弱，没有形成一个觉醒的社会阶层，不可能领导农民革命。起义者自身也有很大的局限，他们轻信敌人，不认识国王是封建统治的最高代表，甚至在自己的旗帜上还绘王徽百合花。作战上兵力分散，武器也不足。

　　尽管扎克雷起义最终失败了，但起义在法国历史上留下了不可磨灭的光辉一页。起义促使农民更迅速摆脱人身依附地位，唤醒了广大农民，提高了农民对封建主进行反剥削斗争的社会觉悟。起义削弱和动摇了封建主在法国北部广大地区的统治，丰富了法国人民同封建主进行武装斗争的经验。在此以后，这些经验又为欧洲其他反封建运动所吸取。