小人国里的动物和自然景物也很小。格里佛一天要吃掉上千头牛羊，国王还让几百个裁缝给他缝制床单和衣服，还用六百个床给他拼接了一张在他们看来无比巨大的床。后来，格列佛以他的善良向小人国的人证明了他并不是个会危害他们的巨人。所以，国王就按照约定给他放开锁链，格列佛获得了自由。
　　格列佛渐渐地熟悉了小人国里的一些非常特别的风俗习惯。比如说，国王爱看大臣们在绳上跳舞，并以此作为评价人才好坏的标准。财政大臣跳得最好，因此他得到了国王的宠爱。有一次，财政大臣差点摔死，幸亏国王用座垫救了他。国王还会拿一根棍子让大臣们跳上跳下，跳得好的就可以得到国王准备的三色丝线，他们把这些丝线扎在腰里以炫耀自己得到国王的钟爱。
　　小人国里有两个党派，高跟党和低跟党。高跟党的人多，但掌握着权力的是低跟党。皇太子的态度不明确，有点倾向于低跟党，所以，鞋子的跟一个高一个低，走起路来一拐一拐的。
　　当时小人国正面临着一场危机，利立浦帝国和不来夫斯帝国因为争论吃鸡蛋时先吃大头还是先吃小头而打了起来。其实，两国之间宿怨已久，战争已经持续了很多年了。大敌当前，受到了利立浦国如此款待的格列佛决定为国立功。他一个人渡过海峡，游到对方的舰队基地，用事先准备好的绳子把船都绑起来，对方的军队发现了他，用箭射击他，他就拿出眼镜保护自己。结果，他没有费很大力气就把不来夫斯帝国的五十艘大船——一个舰队拖了回来。
　　格列佛立了大功，不来夫斯很快就派人来讲和并签署了和平约定。但是利立浦国王的野心很大，命令格列佛把敌国全部消灭掉，被格列佛拒绝了。国王为此很不高兴。这时，王后的寝宫起火，格列佛急中生智用尿帮助把火扑灭。王后不但不感激他，还觉得自己受到了莫大的侮辱。另外，利立浦国的海军大将因为格列佛在战争中抢了自己的风头也很嫉妒他。小人国君臣经过昼夜的商议，拟定了一个罪状，决定以叛国罪刺瞎格列佛的眼睛并把他饿死。
　　一个好心的大臣冒着生命危险把这个消息告诉了格列佛，格列佛连夜卷起铺盖立刻逃到了不来夫斯国。利立浦国要求不来夫斯国交出格列佛，不来夫斯的国王念及格列佛不愿意助纣为虐没有消灭自己的国家，就决定保护格列佛的安全。但是，格列佛思乡心切，后来他发现了一条小船，于是在几千军民的帮助下，他做好了船帆和船桨。带着不来夫斯国的百姓送给他的一些小山羊和小牛以及一捆干草，格列佛乘着小船出发了。在航行途中，他遇到了自己国家的船，于是搭船安全地回到了英国。他把自己带回来的小羊和小牛拿去展览，获得了一笔不错的收入。
　　不久，格列佛乘“冒险号”商船又一次远航印度洋。在途中，他们遭遇了风暴，船偏离了航线，来到大人国。格列佛躲在四十英尺高的麦田里，结果被一个农民发现了，并把他带回家给他的女儿当宠物。格列佛聪明机智不仅深得主人的喜爱，而且不久就名声远扬。他的主人为了赚钱，带着他到全国各地巡回演出。
　　他们来到大人国的首都，王后看中了他，将他买下来作为自己的宠物，格列佛要求农民的女儿留下来做他的保姆和语言老师。在宫廷中，由于他身材玲珑又机智过人，深宠幸，只是经常会受到老鼠、小鸟和狗等动物的侵害。大人国的一切都是跟人的大小成比例的。格列佛用国王的一根头发做了一把梳子，还用王后的头发编制了一个椅子；他在一个水槽里表演帆船，人们吹气给他鼓帆；他需要登上一个专门给他制作的梯子上才能把一页书从头看到尾。
　　格列佛通常被人当成一个宠物来看待，只有有些学识的国王会尊重他些，还要他谈谈英国的政治、经济和文化状况。格列佛在言谈中夸耀自己祖国的伟大，而国王却不以为然，他批评英国的近百年的历史只不过是一大堆阴谋、叛乱、暗杀、屠杀和流放。而格列佛则觉得大人国十分落后，因为国王拒绝学习杀伤性武器的制造方法，他们的法律也很简单，数学方面的知识也只是运用于实践中，军队都是由人民组成的。